Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQX4

Pclaf, PCNA-associated factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PclafQ9CQX4 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PclafQ9CQX4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PclafQ9CQX4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms