Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Map1lc3bQ9CQV6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms