Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PompQ9CQT5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PompQ9CQT5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PompQ9CQT5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PompQ9CQT5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PompQ9CQT5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PompQ9CQT5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PompQ9CQT5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 822.8 ms