Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smim8Q9CQQ0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smim8Q9CQQ0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms