Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccer1Q9CQL2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccer1Q9CQL2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccer1Q9CQL2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms