Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufb9Q9CQJ8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ndufb9Q9CQJ8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ndufb9Q9CQJ8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms