Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Med30Q9CQI9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Med30Q9CQI9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms