Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Q9CQ90 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9CQ90 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms