Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Use1Q9CQ56 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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Use1Q9CQ56 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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Use1Q9CQ56 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Use1Q9CQ56 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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Use1Q9CQ56 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Use1Q9CQ56 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Use1Q9CQ56 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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Use1Q9CQ56 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Use1Q9CQ56 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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Use1Q9CQ56 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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Use1Q9CQ56 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Use1Q9CQ56 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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Use1Q9CQ56 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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