Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ49

Ncbp2, Nuclear cap-binding protein subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncbp2Q9CQ49 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ncbp2Q9CQ49 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ncbp2Q9CQ49 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms