Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV0

Prpf8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf8Q99PV0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Prpf8Q99PV0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Prpf8Q99PV0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms