Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU7

Bap1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase BAP1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bap1Q99PU7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bap1Q99PU7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bap1Q99PU7 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bap1Q99PU7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113 ms