Protein–RNA interactions for Protein: Q99P91

Gpnmb, Transmembrane glycoprotein NMB, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GpnmbQ99P91 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GpnmbQ99P91 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GpnmbQ99P91 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms