Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rtn4Q99P72 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rtn4Q99P72 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rtn4Q99P72 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms