Protein–RNA interactions for Protein: Q99P58

Rab27b, Ras-related protein Rab-27B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab27bQ99P58 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab27bQ99P58 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab27bQ99P58 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms