Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Atoh8Q99NA2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Atoh8Q99NA2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms