Protein–RNA interactions for Protein: Q99N93

Mrpl16, 39S ribosomal protein L16, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl16Q99N93 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Mrpl16Q99N93 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Mrpl16Q99N93 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms