Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pramel1Q99MW3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pramel1Q99MW3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pramel1Q99MW3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms