Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH6

Nkd1, Protein naked cuticle homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkd1Q99MH6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nkd1Q99MH6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nkd1Q99MH6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms