Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PtprtQ99M80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PtprtQ99M80 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PtprtQ99M80 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PtprtQ99M80 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
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