Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gdpd3Q99LY2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gdpd3Q99LY2 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms