Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Chmp1b1Q99LU0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Chmp1b1Q99LU0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms