Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rcbtb2Q99LJ7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rcbtb2Q99LJ7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
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