Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cmtm3Q99LJ5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cmtm3Q99LJ5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms