Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Nmd3Q99L48 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Nmd3Q99L48 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms