Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Rnf34Q99KR6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Rnf34Q99KR6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms