Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lactb2Q99KR3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lactb2Q99KR3 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms