Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH8

Kdelr1, ER lumen protein-retaining receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelr1Q99JH8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Kdelr1Q99JH8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Kdelr1Q99JH8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms