Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Derl1Q99J56 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Derl1Q99J56 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms