Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Smim11aQ99J19 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Smim11aQ99J19 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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Smim11aQ99J19 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smim11aQ99J19 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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