Protein–RNA interactions for Protein: Q925N1

Sfxn4, Sideroflexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn4Q925N1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfxn4Q925N1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sfxn4Q925N1 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sfxn4Q925N1 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 254 ms