Protein–RNA interactions for Protein: Q925H1

Trps1, Zinc finger transcription factor Trps1, mousemouse

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Length 1,281 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trps1Q925H1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trps1Q925H1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Trps1Q925H1 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms