Protein–RNA interactions for Protein: Q923S6

Neurl1, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl1Q923S6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Neurl1Q923S6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Neurl1Q923S6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1Q923S6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1Q923S6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Neurl1Q923S6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms