Protein–RNA interactions for Protein: Q91X93

Prb1, Proline-rich protein BstNI subfamily 1, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prb1Q91X93 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prb1Q91X93 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Prb1Q91X93 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Prb1Q91X93 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms