Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Setd3Q91WC0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Setd3Q91WC0 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms