Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NifkQ91VE6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NifkQ91VE6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms