Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW2

Cacng8, Voltage-dependent calcium channel gamma-8 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng8Q8VHW2 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cacng8Q8VHW2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cacng8Q8VHW2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms