Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Crb1Q8VHS2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Crb1Q8VHS2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Crb1Q8VHS2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.2 ms