Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ppargc1bQ8VHJ7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ppargc1bQ8VHJ7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ppargc1bQ8VHJ7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms