Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE0

Rpe, Ribulose-phosphate 3-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpeQ8VEE0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RpeQ8VEE0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms