Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDN4

Ccdc92, Coiled-coil domain-containing protein 92, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92Q8VDN4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ccdc92Q8VDN4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc92Q8VDN4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms