Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Krt25Q8VCW2 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Krt25Q8VCW2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Krt25Q8VCW2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms