Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RfxapQ8VCG9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RfxapQ8VCG9 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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