Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim29Q8R2Q0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140 ms