Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sumf1Q8R0F3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Sumf1Q8R0F3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sumf1Q8R0F3 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms