Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Nsl1Q8K305 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nsl1Q8K305 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms