Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Neil3Q8K203 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Neil3Q8K203 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms