Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Spire2Q8K1S6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Spire2Q8K1S6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms