Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tmem17Q8K0U3 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem17Q8K0U3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms