Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Upp2Q8CGR7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Upp2Q8CGR7 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms